Es el órgano al servicio de la Conferencia para su información, para la adecuada ejecución de sus decisiones y para la coordinación de las actividades de todos los organismos de la Conferencia (Estatutos. Artículo 40)

Al frente de la Secretaría General está el Secretario General, que es elegido por la Asamblea Plenaria, a propuesta de la Comisión Permanente (Estatutos. Artículo 41). Es el único cargo que tiene mandato por cinco años. Puede ser reelegido para un segundo quinquenio sucesivo (Estatutos. Artículo 42). El Secretario General depende de la Plenaria y de la Permanente (Estatutos. Artículo 43).  Para realizar su trabajo, cuenta con la ayuda de uno o más Vicesecretarios (Estatutos. Artículo 45).

Competencias

El Secretario General, entre otras funciones, es el enlace entre los distintos órganos de la Conferencia y entre estos y los Obispos. Además, recoger y transmitir información a todos los Obispos sobre los asuntos de interés general para la Iglesia en España.

También mantiene contacto con las secretarías generales de otras conferencias episcopales y cuida las relaciones con las provincias eclesiásticas. Además, es el portavoz de los obispos para informar a los medios sobre el desarrollo de las reuniones (Estatutos. Artículo 46).

Para las funciones económicas cuenta con el Vicesecretario para Asuntos Económicos de la Conferencia Episcopal (Estatutos. Artículo 47).

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El material de la Secretaría General anterior a 2020 se puede consultar aquí.